Розшифровано геном "батька" подвійної спіралі ДНК

21/06/2009

Автори моделі подвійної спіралі ДНК Джеймс Вотсон і Френсіс КрікАмериканські учені секвенували геном Джеймса Вотсона - одного з авторів моделі просторової структури ДНК. Для визначення послідовності ДНК Вотсона автори використовували нову технологію, яка дозволила їм істотно скоротити час і вартість секвенування. Робота учених опублікована в журналі Nature.

Дослідникам вдалося "прочитати" шість мільярдів нуклеотидів за два місяці. На весь проект із секвенування генома Джеймса Вотсона вони витратили менше півтора мільйона доларів. Для порівняння, проект "Геном людини" тривав в цілому 15 років і обійшовся майже в три мільярди доларів. Секвенування генома Крейна Вентера - вельми неоднозначної фігури в науковому світі - обійшлося в сто мільйонів доларів.

Однією з технологічних особливостей нового методу секвенування ДНК є використання істотно коротших відрізків ДНК для безпосереднього "прочитання", ніж використовували автори "Геному людини". Якщо при реалізації проекту "Геном людини" для секвенування брали короткі ділянки завдовжки від 500 до 1000 нуклеотидів, то новий підхід передбачає розрізання хромосомів на шматки, довжина яких не перевищує 250 нуклеотидів.

ДНК людини упакована в хромосоми, кожна з яких містить сотні тисяч нуклеотидів. Для того, щоб визначити нуклеотидний склад хромосомів, їх розрізають на шматки, які "прочитують" окремо. Кожний з шматків частково перекривається з сусіднім. Використовуючи ділянки, що перекриваються, отримані відрізки "тексту" вибудовують по порядку і в результаті одержують послідовність цілої хромосоми.

У цього методу існує недолік: з його допомогою важко відновити точну послідовність ДНК в місцях, багатих на повтори. Маючи тільки багато коротких (і через повтори майже однакових) секвенованих послідовностей, неможливо точно визначити, скільки саме повторів знаходиться в цій ділянці хромосоми. Використання нової технології з коротшими фрагментами для секвенування створює додаткові труднощі при вибудовуванні послідовності цілої хромосоми.

Багато учених, зокрема, Крейг Вентер, завдяки якому проект "Геном людини" був завершений на п'ять років раніше планованого терміну, вважають, що недолік нової технології може перешкодити її повсюдному застосуванню.

Повернутися до списку публікацій



Останні новини

Статті

Попередні публікації